超聲波清洗器清洗作用的實現，主要是靠“空化效應”。故“空化”效果之優劣，能左右機器性能；而機器性能高下則決定清洗效果。欲達清洗目的，應追其根溯其源，因此對空化效應之影響因素，不可不察也。
(1)頻率的選擇
清洗液中即使通入超聲波，并不一定能夠產生空化小泡；即使產生了空化小泡，也不一定能夠*爆破；即使爆破了，也不一定能夠達到良好的剝脫污物的效果。
每一種液體都有自己的“空化閾值”。就是超聲波振動產生的負壓超過了液體本身的靜壓力，才能將其撕開，形成真空泡。超聲空化閾值與超聲波頻率有密切的關系。
頻率越高，空化閾值越高。因為超聲波的頻率越高，它的能量就會很低，沒有那么大的力氣撕開液體形成空泡。所以高頻率的超聲波不容易在液體中形成空化泡，要產生空化，就需要加大聲功率。
反過來，頻率越低，產生空化就越容易。而且，頻率低了，撕開和擠壓兩者之間的時間間隔就多了許多，生成的小泡有足夠的時間來完成生長，由小變大，那么它爆破時產生的沖擊力就更大了，更有利于清洗。
高頻與低頻，就像馬跑得很快，但力氣小，拉不了太多的重物；而牛跑得很慢，但力氣很大，拉著一大車牛糞都能夠閑庭散步，其實各有用處。
我們可以根據清洗對象將超聲波頻率分為3個頻段：低頻(20KHz—50KHz)，高頻(50KHz—200KHz)，超高頻(700KHz—1MHz以上)。在相同的功率下，40KHz頻率的超聲波比100KHz的超聲波產生更多的空化泡，穿透能力更強，但容易造成器械表面的腐蝕和損壞，噪聲也更大。
因此，高頻超聲波適用于清洗精密精細的器械，低頻超聲波適用于清洗粗大堅固的器械。
(2)清洗液性質的影響
超聲清洗槽的水里往往需要加入清洗劑，清洗劑的選擇，一方面要根據污物種類選擇針對性的清洗劑，另一方面，需要考慮清洗劑對水造成的表面張力和粘滯度等性質的改變，因為這些性質都與空化強度有關。液體表面張力越大，空化難度越大。就像要撕開一張薄膜和一張牛皮，張力越大，需要的力度就越大。同時液體粘滯度大，也不容易產生空化。所以，應當選擇粘滯度小的清洗劑。
(3)溫度的影響
溫度升高，有利于空化的產生。但溫度過高，反而會降低空化泡的形成。而且每一種液體都有各自的活躍溫度，水活躍的溫度為60度左右。如果考慮到多酶清洗劑的耐受溫度，可以選擇40度左右為宜。
(4)氣體的影響
超聲波在傳播過程中，如果遇到水中的氣泡(不是空化泡)，它的傳播就會收到影響，導致空化泡產生收到影響。另外，生成的空化泡如果擴散到空氣泡中，在爆破的時候會降低它產生的沖擊力度，影響清洗效果。因此，超聲波清洗機在使用之前，應當排除水中的氣泡。
(5)其他影響
被清洗物品對超聲波清洗效果也有影響。塑膠、布料類的器械和物品，由于具有吸聲效果，清洗效果很差；而對超聲波反射能力強的器械，如不銹鋼、玻璃等，清洗效果就會很好。另外，裝載籃筐的網眼過密、器械放置過多、污染過重也可能導致超聲波能量的衰減，減弱清洗效果。
